随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代——
阿久津瑛太是一位孤独、内向的机甲宅男。他甚至还暗恋过一个女孩。她是吾妻真希奈，一位极其美丽、开朗且受欢迎的女孩。一天晚上，马基纳出现在瑛太家门口。她的身体似乎有些奇怪，当她突然露出赤裸的身体时……那是一个机械身体，而不是人类身体！ Makina 是一款专为性爱而打造的人工智能机器人，但其访问成人信息受到限制。 Eita 是一名处女，但对女性有洁癖，而且极其善良。他们两个开始一起生活，不允许任何人透露他们的真实身份！
赫萝的出现，改变了劳伦斯原本孤独的经商生活。虽然常常被赫萝狡猾的言论捉弄，但他与赫萝的羁绊也因此越来越深在世界各地旅行并收购贩卖物品的旅行商人克拉福•劳伦斯在经过正在庆祝收获节的帕斯罗村后离开，却在自己堆满麦束的货车上发现了正在睡觉的少女。少女有狼的耳朵和尾巴，更有美丽的脸庞，她自报家门称自己是掌管丰收的狼神“赫萝”。虽然对这样的介绍半信半疑，但在赫萝的花言巧语之下，劳伦斯答应带赫萝回到遥远的北方故乡，就这样二人展开了旅行商人的旅程，并在行商途中遇到了各式各样的事件。
2055年。手のひらサイズの小型ロボット「LBX」は世界最高のホビーと称され、プロリーグの設立などビジネスにおいても大きな存在感を放つ時代となっていた。そんな中、選りすぐりのプレイヤーが集うLBXのための学校「神威大門統合学園」に転入した少年、『瀬名アラタ』と『星原ヒカル』を待っていたのは、想像を超える出来事であった。学園の地下に広がる、直径10kmの巨大ジオラマ。放課後にそこで繰り広げられる、「ウォータイム」という学園独自の謎の規則。そして、LBX完全破壊（ロスト）による退学…。クラス委員長『出雲ハルキ』のチーム「第1小隊」に配属されたアラタとヒカルは、転入した2年5組、通称【ジェノック】のLBXプレイヤーとして、幾多の思惑が渦巻く学園の謎を背景に、壮絶な運命へと身を投じる――！
支遁動物記」編
作为动画3期的先行，以《摇曳百合：暑假时光+》为题的新作动画将分别于2015年8月和9月各放送1话，内容则是2014年11月上映的《摇曳百合：暑假时光》的后续
故事以18世纪的欧洲为舞台，在当时的意大利某小镇上，有着日本血统的孤儿天马和喜爱绘画的亚伦是一对挚友。某日亚伦受到大圣堂的神父 ( 睡神修普诺思) 的指引，去到一处被称为“地面上的极乐净土”的地方寻找“真实之红”。在那里亚伦遇到了一个叫“潘多拉”的神秘少女，自此亚伦的身体开始发生了变化。
动画舞台设定在1999年、14岁的明智安娜从2027年穿越回1999年的真未来市、在那里她结识了同为14岁、憧憬成为名侦探的少女小林未来、两人目睹了幻影怪盗团夺走人们珍贵之物、令众人陷入困扰的情景后决定挺身而出，变身为名侦探光之美少女。
迷宫都市勒温。这个小镇聚集了许多冒险者，那里有一个怪物出没的迷宫。失去生命又转世的主角在迷宫中醒来。怎么看都像只小猫啊！ ？然而它的真实身份却是灾难级S级怪物‘巨兽’的幼年形态！他遇见了初出茅庐的D级冒险者阿莉亚。阿丽亚误认为他是一只小猫，把他带回家，在那里他受了重伤，治疗了他，并把他当作宠物，给他起名叫“小玉”。小玉被他的善良所感动，发誓要成为一名骑士来保护阿莉亚。小玉利用她的 S 级力量与阿莉亚一起在迷宫中冒险。你作为骑士（宠物）的日子从你遇到独特的朋友并且有时被宠爱开始！
