影片背景设置在11世纪的波斯，一位英国人为了学习医术掩盖其天主教徒的身体，加入了伊斯巴罕一所只招收犹太人的医学院。他治随的老师名叫阿维森纳，是历史上著名的犹太科学家、思想家和医生。阿维森纳的著作达200多种，最著名的有《哲学、科学大全》，在当时是高水平的百科全书；另一部 巨著是《医典》，直到17世纪西方国家还视为医学经典，至今仍有参考价值。《神医》结合史诗与虚构，展现了在那个被愚昧和迷信统治的世纪里一群人探索真知的无畏精神。
十年前两个留守儿童燕子、陈路和年轻企业家张老师的故事。两个15岁的女孩都在贵州某乡村中学读初三，张老师是年轻企业家，因为热心于公益事业，独自前往贵州某乡村中学任职音乐老师。由于两人想参加学校张老师组织的合唱团，一个女孩有“百鸟衣”，而另外一个女孩没有百鸟衣，他们即将面临选择。同时，还要面临另外一个选择的是陈路，因为家庭环境的原因，她想放弃学业。作为朋友的燕子，始终在劝说陈路放弃想法，并在张老师的支持下回归学业。一无所有的两人相互依偎取暖，姐妹情深让逆境中的他们依旧乐观开朗。然而，由于命运的转折，陈路最终不得不离开了燕子。十五年后，两人再次重逢，却早已物是人非，燕子通过自己的努力在城市站稳脚跟后，也像当年的张老师一样，开始帮助一个又一个的留守儿童……
影片讲述了朴信惠和全钟睿饰演的生活在两个不同时间线上的女子，因为一通电话而发生关联的惊悚故事。
高速公路上，屌丝佟子只恨车破，穷追前面的奔驰，豪车内思豪百般挑逗林歆，追至别墅前思豪痛殴佟子。佟子使出离间计，却被林歆无情羞辱得体无完肤。绝望中，佟子拿着父母的养老钱投入黄金杠杆交易，迅速暴富。他迫不及待地炫富，嚣张如演戏般地戏谑林歆，痛殴思豪。人生如戏，马失前蹄，佟子举债缠身再次栽在思豪手里遭受奇耻大辱。佟子拼死赢得炒金圣手的援助，在思豪林歆的婚礼上怒演：用钱砸死你！
过去悲惨的经历让青年李锦伦（谭咏麟 饰）的个性慢慢变得扭曲不堪，对社会充满了仇恨。某日，他在误打误撞之下杀了人，负责此案的探长（彭建新 饰）在报纸上公然宣称此案的凶手必定是个弱智的性无能，这让李锦伦感到十分愤怒。探长戴骠（董骠 饰）得知李锦伦正是案件的罪魁祸首，又意外得知他是一个孝子，于是心生一计。戴骠假意追求李锦伦的母亲（邓碧云 饰），李锦伦知道此事必有蹊跷，担心母亲受其利用，便想要杀了戴骠灭口，戴骠一记假死骗过了李锦伦，之后又在他的家中设下了重重计谋，一步一步诱导李锦伦落入了圈套，李锦伦误以为自己杀死了最爱的母亲，崩溃下最终落入法网。
振宇（王泽宣饰）收到一份匿名包裹，暗示十五年前导致其父亲振江明丧生的爆炸案背后另有隐情。线索隐藏在一款名为“侦探”的游戏隐藏区域中。振宇随即进入游戏，结识了神秘女孩北辰（周薇薇饰）、性格古怪的董宁（罗雨桐饰）和乐观向上的贾晓菲（张昊哲饰）。四人在案件中发现了一些与自己有关的神秘线索，真相也越来越扑朔迷离。
